这里是斗魂晶核所创造出的异世界“战魂界”（Spirits World），也是所有战魂来源的世界。过去由于将斗魂晶核作为自己的力量而使用的邪神皇而使这个世界面临崩毁的危机，而当时的勇者们借由十二神皇战魂的力量将那位邪神皇封印了。
力量耗尽的十二神皇战魂们不知沉睡到了何处，世界迎来了长久的和平。然而，巫女爱德得知为了得到斗魂晶核之力而想要将邪神皇复活的势力“暗黑斗士”的存在。为了守护和平，必须要像过去一样将“勇者们”聚集起来，爱德为了躲避暗黑斗士的追踪而出逃，从而展开了旅程。
借由爱德的祈祷，被十二神皇战魂所选中的异世界的少年，茂上骏太和约克?阿尔巴特罗萨，被引导到了战魂界，和她一同开始了冒险。